Temporal expression analysis of angiogenesis-related genes in brain development

Özkan, Abdulkadir; Biçer, Atilla; Avşar, Timuçin; Şeker, Aşkın; Toktaş, Zafer Orkun; Bozkurt, Süheyla Uyar; Başak, Ayşe Nazlı; Kılıç, Türker

doi:10.1186/2045-824X-4-16

Vascular Cell

Table 2 Normalized expression values of 62 expressed genes according to functional groups

From: Temporal expression analysis of angiogenesis-related genes in brain development

Growth factors and receptors					Proteases, inhibitors and other matrix proteins
Gene	E	P	Av	Adult	Gene	E	P	Av	Adult
Bai1	0,24	0,27	0,26	0,05	Angptl4	0,12	0,09	0,10	0,11
Col18a1	0,13	0,08	0,10	0,07	Ecgf1	0,06	0,08	0,07	0,09
Ctgf	0,13	0,25	0,20	0,13	F2	0,04	0,05	0,05	0,11
Edg1	0,32	0,44	0,39	0,15	Mmp2	0,13	0,16	0,15	0,11
Egf	0,05	0,06	0,05	0,06	Mmp9	0,09	0,07	0,08	0,05
Ephb4	0,33	0,20	0,25	0,16	Plau	0,04	0,04	0,04	0,04
Fgf1	0,04	0,06	0,05	0,13	Timp2	0,34	0,38	0,36	0,22
Figf	0,03	0,06	0,05	0,16	Timp3	0,36	0,33	0,34	0,20
Flt1	0,05	0,06	0,06	0,15
Igf1	0,06	0,06	0,06	0,12	Transcription factors and others
Il18	0,27	0,59	0,45	0,23	Gene	E	P	Av	Adult
Jag1	0,14	0,09	0,11	0,08	Akt1	0,89	0,74	0,80	0,29
Kdr	0,06	0,04	0,05	0,01	Angpt2	0,09	0,09	0,09	0,07
Mdk	0,53	0,27	0,38	0,13	Efna1	0,08	0,09	0,09	0,05
Notch4	0,07	0,06	0,06	0,03	Efna2	0,26	0,19	0,22	0,16
Npr1	0,15	0,12	0,13	0,15	Efna3	0,05	0,06	0,05	0,07
Nrp1	0,96	0,83	0,88	0,52	Efnb2	0,70	0,58	0,63	0,19
Nrp2	0,07	0,06	0,06	0,06	Hif1a	0,10	0,07	0,08	0,14
Pdgfa	0,67	0,85	0,77	0,48	Lect1	0,08	0,19	0,15	0,02
Pgf	0,08	0,05	0,06	0,02	Mapk14	0,52	0,53	0,53	0,17
Prok2	0,06	0,04	0,05	0,09	Notch4	0,07	0,06	0,06	0,03
Ptn	0,29	0,38	0,35	0,30	Nudt6	0,11	0,10	0,11	0,14
Tek	0,14	0,13	0,13	0,16	Pofut1	0,14	0,09	0,11	0,14
Tgfb2	0,07	0,04	0,05	0,16	Pten	0,04	0,03	0,04	0,02
Tgfb3	0,39	0,25	0,31	0,21	Ptgs1	0,08	0,15	0,12	0,07
Tgfbr1	0,05	0,03	0,04	0,04	Sphk1	0,13	0,14	0,14	0,21
Tnfrsf12a	0,08	0,05	0,06	0,07	Tbx1	0,05	0,04	0,05	0,05
Vegfa	0,10	0,10	0,10	0,15
Vegfb	0,62	0,58	0,60	0,29	Cytokines and chemokines
Vegfc	0,13	0,08	0,10	0,11	Gene	E	P	Av	Adult
					Ccl2	0,03	0,07	0,05	0,03
Adhesion molecules					Csf3	0,13	0,11	0,12	0,14
Gene	E	P	Av	Adult	Cxcl9	0,12	0,09	0,10	0,12
Cdh5	0,09	0,15	0,12	0,10	Il10	0,06	0,07	0,07	0,07
Col18a1	0,13	0,08	0,10	0,07	Il12a	0,92	0,90	0,91	0,48
Ctgf	0,13	0,25	0,20	0,13	Tnf	0,08	0,05	0,07	0,05
Il18	0,27	0,59	0,45	0,23
Nrp2	0,07	0,06	0,06	0,06
Pecam1	0,03	0,03	0,03	0,02
Thbs2	0,08	0,06	0,07	0,06
Tnfrsf12a	0,08	0,05	0,06	0,07

*Some genes are listed in more than one functional group. E: Embryonic average, P: Postnatal average, Av: Developmental average.

Back to article page

ISSN: 2045-824X

Contact us

General enquiries: info@biomedcentral.com